pytania

Myślę, że warto spisać co kto pamięta. W końcu specjalnie dla nas wymyślono nowe zestawy, pewnie przydadzą się naszym następcom (mam nadzieję, że nam już nie)

ZESTAW 3

Część pierwsza

1. białka z domenami hydrofobowymi, jak się nazywają, jaką pełnią funkcję w organizmie.
2. rola fosfoglukomutazy w glikolizie (reakcja)
3. ATP posiada dużą delta G, jego wiązania ulegają hydrolizie, to dlaczego jest przechowywany i transportowany w środowisku wodnym.
4. Cykl Krebsa – wypisać reakcje redox, co się dzieje potem z elektronami?
5. Glikoliza, wypisać reakcje w których następuje fosforylacja substratowa
6. Estrogeny, wzór dowolnego przedstawiciela oraz jego rola
7. Fosforan pirydoksalu – wzór i rola w organizmie
8. HMG-CoA napisać reakcję rozkładu na ciała ketonowe
9. Synteza jakiegoś związku, w jakim szlaku występuje
10. Synteza cysteiny, co sądzisz o zaliczeniu jej do aminokwasów endogennych? (cytat Very Happy

)
11. Pięć typów wiązań wysokoenergetycznych
12. Inhibicja niekompetencyjna, narysować wykres, na czym polega
13. Stan równowagi – opisać go i narysować wykres
14. Czy strukturę 4 rzędową determinują domeny, skład aminokwasowy itd. (wymienione wszystko po kolei)
15. Glikolipidy błonowe, jakie maja części (chodziło o hydrofobowa i hydrofilową, pewnie też o wzór)
16. Losy pirogronianu w mięśniach szkieletowych w przypadku braku tlenu
17. Efekt kooperatywności, jakich białek on dotyczy?
18. Narysuj część cząsteczki THFA która odpowiada za przenoszenie reszt jednowęglowych. Jakie cząsteczki przenosi?
19. Jakie reakcje katalizują kinazy, ze względu na co możemy podzielić kinazy

Część druga

1. Jakie polimerazy biorą udział w transkrypcji u eucariota
2. Jakie geny kodują łańcuchy ciężkie immunoglobulin
3. czym się różni operator od operonu
4. jakie cechy wspólne posiada syntetaza aminoacylo-tRNA oraz polimeraza DNA zależna od DNA przy translacji
5. Gdzie mogą zostać skierowane białka z reticulum endoplazmatycznego
6. Rola białka CAP w przemianach katabolicznych
7. Z jakiejś tam sekwencji aminokwasowej zrobić tranzycję i transwersję
Ze swojego tyle pamiętam.

w tym teście jeszcze było pytanie:
18. Jakie reszty przenosi THFA nazwać narysować i narysować THFA (coś takiego)

Tam bylo chyba o niekompetencyjną inhibicją, a po drugie chyba to fosfoglukomutaza, a nie fosfogliceromutaza

1. Skąd pochodzi energia do transportu Na i K. Jaki typ aktywności enzymatycznej wykazuje ta pompa.
2. PLP narysować i w jakich reakcjach jest koenzymem.
3. Podstawowa reakcja deaminacji aminokwasów.
4. Co u przeżuwaczy wchodzi do Cyklu Krebsa i w jaki sposób- napisać schemat reakcji.
5. PRPP- do jakich reakcji.
6. Reakcja prowadząca do powstania AMP. Jaki ona szlak kończy.
7.Do czego jest wykorzystywana energia ATP.
8. Dlaczego w mięśniach powstaje mleczan.
9. Rola cukrów w glikoproteidach.
10. Zamykanie pierścienia proliny.
11. Co powstaje w wyniku rozkładu kw. tłuszczowych o nieparzystej liczbie węgla.
12. Reakcja katalizowana przez fosfofruktokinazę i fruktozo-1,6-bisfosfatazę. Co wpływa na ich czynność.
13. Co jest HDL i jego obieg w organizmie.
14. Narysować FAD i NAD.
15. Czemu mioglobina i hemoglobina mają takie same struktury.
16. Co to jest sprawność katalityczna enzymu.
17. Co to jest kooperacja i allosteria z przykładami.
18. Czy fosfoenolopirogronian jest wysokoenergetyczny, narysowac i zaznaczyć wiązanie wysokoenergetyczne.
19. Jak wygląda przekazywanie energii z ATP. Z czego powstaje energia na jego syntezę.

1. Jaką aktywność na polimeraza DNA.
2. Co to są białka rekombinowane i jak powstają. Napisać jaki wektor i jakie sekwencje musi zawierać.
3. Co to jest represor, korepresor, aktywator napisać przykłady.
4. Rysunek klonowania.
5. Miejsce wiązania acylo-tRNA na rybosomie i czemu taka nazwa.
6. Zakończenie transkrypcji u procariota.
7. Karcynogeny pośrednie i bezpośrednie co to jest.
8. Cechy kodu genetycznego.
9. Część zmienna i stała immunoglobuliny co to jest.

Sorry, fosfoglukomutaza oczywiście. Zmęczona trochę byłam już Smile

1. struktury rezonansowe w wiązaniach peptydowych, jak wpływają na właściwości łańcuchów polipetydowych
2. czy glukozo-6-fosforan jest związkiem "wysokoenergetycznym"? Jeśli tak to wskaż wiązanie wysokoenergetyczne na przykładzie glukozo-6fosforanu
3. czy asparagina jest aminokwasem endogennym? jeśli tak napisz odpowiednią rekację
4. Przez ile pomp protonowych przechodzą elektrony z FADH2? reakcja powstawania FADH2 w cyklu kwasy cytrynowego
5. tlenowy i beztlenowy metabolizm pirogronianu
6. podstawowy wzór na początkową prędkość reakcji. Wzory na prędkość reakcji enzymatycznej w przypadku niskiego oraz wysokiego stężenia substratu
7. jakiego enzymu związanego z metabolizmem glukozy brak w mięśniach? w jakich narządach jest ten enzym?
8. wzór aldehydu glutaminianowego(?), w jakich szlakach metabolicznych występuje
9. dowolna reakcja redoks w B-oksydacji
10. dehydratacja 3-hydroksybutyrylo-ACP
11. sekwencja aminokwasów w alfa-kolagenie. Specyficzna struktura alfa-kolagenu
12. gradient protonowy. Jak powstaje? Do czego służy?
13. synteza ceramidu
14. kofaktory, koenzymy w dekarboksylacji alfa-ketokwasów
15. prekursory glukozy w procesach glukoneogenezy
16. schemat struktury porfiryny. W jakich enzymach występuje?
17. skład monomeryczny i wiązania w: celulozie, hemicelulozie, pentozanach i pektynach

1. geny kodujące łańcuch lekki (L) immunoglobulin
2. obróbka potranskrypcyjna mRNA
3. kolejne czynności w tworzeniu myszy transgenicznych
4. replikacja u Procaryota - ciągła czy nie ciągła? uzasadnij
5. czy jedno tRNA może rozpoznawać więcej niż jeden kodon? krótko uzasadnij
6. represja poprzez białko represorowe w operonie laktozowym
7. metody blottingu: Norther, Southern, Western; jakich cząsteczek dotyczą?

Ja mialam ten sam zestaw co skoora Wink

Tam bylo jeszcze cos w stylu:
Związki z rozkładu aminokwasów, które wchodzą do glukoneogenezy (?)
i jeszcze mi się przypomniało:
Chaperony - co to i do czego służy?
Cośtam z syntezą albo rozkładem proliny, ale być może to było do tego z aldehydem glutaminianowym Wink

O to tego nie pamietam... Ale przypomniało mi się jeszcze: różnice między pompą jonową a kanałem jonowym.

Zestaw 10

część I:
- powstawanie karbamoilofosforanu i jakie znasz reakcje metaboliczne, w których bierze udział
- co odpowiada za IV rzędową strukturę białek
- co jest III rzędową strukturą
- co jest bezpośrednią przyczyną anemii sierpowatej
- centrum aktywne-definicja, jakie znasz rodzaje
- cykl katalityczny-definicja i schemat, narysuj wykresy Lkogośtam-Burka dla hamowania akompetencyjnego
- ile minimalnie musi wynosić delta G aby reakcja była uznana za wysokoenergetyczną..czy guanidynofosforany są wysokoenergetyczne, narysuj przykład takiego związku i zaznacz wiązanie
- co odpowiada za transport glukozy do komórki i co zapobiega jej 'ucieczce' z komórki
- funkcje białek błonowych
- czy seryna jest a.endogennym, jeśli tak jedna z reakcji jej powstawania
- hydratacja w beta oksydacji
- wzór fosfatydyloinozytolu i jego funkcja
- reakcjE katalizowane przez akonitazę i w jakim to cyklu
- wzór FAD utl. i zred.
- wzór hormonów tarczycy i od jakiego aminokwasu pochodzą
- wzór kw.arachidonowego, jakich związków jest prekursorem i za co odpowiadają te związki
- coś o trawieniu celulozy u przeżuwaczy i pierwotniakach które to robią, narysuj celulozę
- narysuj laktozę i coś o jej syntezie w gruczole mlekowym
- jaki enzym jest odpwoedzialny za syntezę ATP w fosforylacji oksydacyjnej, głowne cechy tego enzymu
- powstawanie pirogronianu i jaki enzym to katalizuje

część II:

- dlaczego replikacja jest semikonserwatywna
- co odpowiada za aktywację aminokwasów w syntezie białka
- kosmidy
- bąbel transkrypcyjny, składowe
- schemat operonu tryptofanowego co odróżnia go od innych operonów
- wymień domeny wiążące się do DNA

2 TERMIN

ZESTAW 1

A1. Witamina B1, czego jest koenzymem, wzór
A2. Wpływ temperatury na enzymy, narysować stosowny wykres ogólny, oraz jeszcze parę innych wykresów dla różnych temperatur.
A3. Narysuj znane ci typy wiązań wysokoenergetycznych, zdefiniuj wiązanie wysokoenergetyczne, po co one są w organizmie.
A4. Regulacja rozkładu i sytnezy glikogenu. Kaskada
A5. Powstawanie 3HMG-CoA, jakie są jego losy, co z niego powstaje, narysować wzory i opisać funkcje biol.
A6. Prolina, zamykanie pierścienia, w jakich białkach występuje, jak wpływa na strukture 2 rzędową, wzór.

B1 Para zasad w DNA, narysować dowolną, jak komplementarność zasad wpływa na syntezę DNA i ogólnie opisać co to jest, jakie wiązania stabilizują.
B2. Aminoacylo-tRNA - dlaczego tyle rodzajów, WOBBLE, degeneracja kodu
B3. Southern, Nothern, Western blotting, jakich cząsteczek dotyczą, narysować schematycznie jak przebiegają
B4. Tranzycja, transwersja, delecja z podanej sekwencji, jakie mogą być skutki tych mutacji

wszystko Wink

Ogólna:
1. Struktury drugorzędowe białek - cechy + szkic
2. centrum aktywne - co to + podział, co to koenzym i grupa prostetyczna
3. reakcje tlenowej dekarboksylacji z cyklu Krebsa i pirogronianu, jakie koenzymy itp
4. dlaczego w mm. powstaje mleczan skoro jest trujący, 3 ostatnie reakcje glikolizy i powstanie mleczanu, co się z nim później dzieje
5.synteza kw. tłuszczowych, reakcje i skąd są substraty, z jakich szlaków metabolicznych
6. semialdehyd glutaminianowy (czy coś koło tego) z jakich aa, reakcja powstanie, co się z nim dzieje dalej, reakcje, jakie szlaki

tak to mniej więcej brzmiało

B1 Narysuj schemat widełek replikacyjnych ,wymień enzymy i białka biorące udział w procesie replikacji
B2 Wymień różnice w transkrypcji u procaryota i eucaryota
B3 Rekombinacja zlokalizowana opisz na przykładzie łańcuchów ciężkich immunoglobin
B4 Dideoksyrybonukleotydy-wzór , w jakich reakcjach biorą udział

1. Białka błonowe , budowa funkcja plus rysunek. CZy bialka blonowe moga byc glikoaminokwasami ? Uzasadnij.
2. Gradient protonowy, jak powstaje , gdzie co jest bezposrednio przyczynia sie do jego powstania. do czego jest wykorzystywany gradient - 5 funkcji
3. Synteza triacylogliceroli.
4. Cykl mocznikowy
5. wyjasni pojecia zwiazane z enzymami : stala katalityczna, aktywnosc enzymatyczna,(dalej nie pamietam)
6. Jaki kwas wolny powstaje w zoladku przezuwaczy i jak przechodzi w glukoneogenezie czy jakos tak..

1.koenzymy dehydrogenaz narysuj
2. wiazanie peptydowe narysuj, wlasciwosci, funkcje
3. lipidy blonowe, najwazniejsze grupy plus wzory
4. aktywacja kwasow tluszczowych i transport
5. kinazy bialkowe co robia, wplyw na regulacje i metabolizm
6. wypisz aminokwasy endogenne, podaj synteze dwoch

ZESTAW 9
B1 sekwencje sygnałowe
B2 proces terminacji translacji u procariota i eucariota
B3 amplifikacja DNA i PCR
B4 redagowanie mRNA i splicing alternatywny - czy to te same procesy i na czym polegaja